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微生物の持つ多様な生理機能や微生物が生産する酵素などの機能を分子、遺伝子、微生物細胞、微生物の集団の各レベルで解析し、利用するための研究を行っています。主なテーマは、セルロース分解酵素とその遺伝子の解析およびその改良、バイオマスの有用物質やバイオエネルギーへの変換、環境浄化、微生物や植物細胞の分子育種法開発などで、遺伝子工学やタンパク質工学、代謝工学などバイオテクノロジーの手法を用いています。