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有用微生物の生理機能を遺伝子レベルで解析し応用するための研究を行っています.主なテーマは,微生物の遺伝子工学や代謝工学による改良,微生物や植物細胞の分子育種法開発などで,特に嫌気性細菌を対象に分子遺伝学的手法を応用してバイオマスをバイオエネルギーへ効率的に変換する研究に力を入れています.さらに微生物が生産するバイオマス分解酵素の遺伝子発現制御機構の解明も行っています.